대한불교조계종 제11교구 본사인 불국사(佛國寺)의 말사이다. 신라 때 창건되었다. 당시에는 영혈사(靈穴寺)라고 하였다. 자세한 연혁은 전하지 않는다. 다만 1592년(선조 25) 임진왜란이 끝난 뒤 자헌대부동지중추부사(資憲大夫同知中樞府事) 조임(趙任)이 중창하여 성지(性智)를 머물게 하고 절 이름을 연대암으로 고쳤다. 현존하는 당우로는 대웅전과 관음전이 있다.
유물로는 2013년 경상북도 유형카지노 가입머니재(현, 유형카지노 가입머니유산)로 지정된 영양 삼지동 모전석탑과 금니도금불좌상(金泥塗金佛坐像) 5위가 있다. 석탑은 신라 때의 것으로 추정된다. 5위의 불상은 1963년에 석탑을 수리 중 상부의 현실(玄室)에서 나온 것으로 신라 말 고려 초에 조성된 것으로 추정된다. 이 밖에도 극락전 뒤에는 자연석굴이 있는데, 이곳에서 나오는 석간수의 청탁으로 사람들이 농사의 길흉을 점친다고 하여 영혈(靈穴 : 또는 靈泉)이라 한다.